At1g55350 SYNGENTA 102227
Genomic Sequence (from TAIR)
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BLAST Details: Query Sequence: 102227_RB Length: (852 letters) Database: Genes from AGI, Total Genome (DNA); Smallest Sum High Probability Sequences producing High-scoring Segment Pairs: Score P(N) N At1g55350 68414.t05796 calpain-type cysteine protease fam... 3095 3.4e-134 1 >At1g55350 68414.t05796 calpain-type cysteine protease family identical to calpain-like protein GI:20268660 from [Arabidopsis thaliana]; contains Pfam profiles: PF00648 Calpain family cysteine protease, PF01067 Calpain large subunit,domain III; identical to cDNA calpain-like protein GI:20268659 Length = 11,171 Plus Strand HSPs: Score = 3095 (470.4 bits), Expect = 3.4e-134, P = 3.4e-134 Identities = 619/619 (100%), Positives = 619/619 (100%), Strand = Plus / Plus Query: 234 AGGTTATAGTGCCGGTGGCTGCCAAGATTATAGCTCATGGCATCAAAATCCACAATTCAG 293 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10016 AGGTTATAGTGCCGGTGGCTGCCAAGATTATAGCTCATGGCATCAAAATCCACAATTCAG 10075 Query: 294 GCTGAGGGCAACTGGTTCTGATGCATCTTTACCAATTCATGTGTTCATCACCTTAACTCA 353 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10076 GCTGAGGGCAACTGGTTCTGATGCATCTTTACCAATTCATGTGTTCATCACCTTAACTCA 10135 Query: 354 GGCACATGCTATCCCTTGATGGAAACTTTTTCTATCTATAATTCTTTTGTAATTATCCTC 413 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10136 GGCACATGCTATCCCTTGATGGAAACTTTTTCTATCTATAATTCTTTTGTAATTATCCTC 10195 Query: 414 AGCTCATTCTCCCAATGTTACTTACAGGGCGTAGGTTTCTCGAGAACAACTCCTGGATTT 473 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10196 AGCTCATTCTCCCAATGTTACTTACAGGGCGTAGGTTTCTCGAGAACAACTCCTGGATTT 10255 Query: 474 CGTAACTACCAATCAAGCCATGATTCACAGTTGTTCTATATCGGATTGAGGATTCTTAAA 533 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10256 CGTAACTACCAATCAAGCCATGATTCACAGTTGTTCTATATCGGATTGAGGATTCTTAAA 10315 Query: 534 ACTCGTGGACGTCGTGCTGCTTACAACATATTTCTTCATGAATCTGTTGGTGGAACAGAC 593 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10316 ACTCGTGGACGTCGTGCTGCTTACAACATATTTCTTCATGAATCTGTTGGTGGAACAGAC 10375 Query: 594 TATGTGAATTCCCGTGAGATTTCATGTGAAATGGTTCTTGACCCTGATCCTAAGGGTTAT 653 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10376 TATGTGAATTCCCGTGAGATTTCATGTGAAATGGTTCTTGACCCTGATCCTAAGGGTTAT 10435 Query: 654 ACTATTGTCCCAACCACGATACACCCAGGGGAAGAAGCACCTTTTGTCCTTTCAGTCTTC 713 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10436 ACTATTGTCCCAACCACGATACACCCAGGGGAAGAAGCACCTTTTGTCCTTTCAGTCTTC 10495 Query: 714 ACAAAAGCATCCATTGTTCTTGAAGCTTTGTAGTGCCCGTATTGTCAGATGGCTCTCTCA 773 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10496 ACAAAAGCATCCATTGTTCTTGAAGCTTTGTAGTGCCCGTATTGTCAGATGGCTCTCTCA 10555 Query: 774 GCAACCTGCATGCCATGAAATCATCCAAGTGCTTGTGTTGTTTAAGGAACCAGACGGCTT 833 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10556 GCAACCTGCATGCCATGAAATCATCCAAGTGCTTGTGTTGTTTAAGGAACCAGACGGCTT 10615 Query: 834 ACGTCTCAATGTTAAGACT 852 ||||||||||||||||||| Sbjct: 10616 ACGTCTCAATGTTAAGACT 10634