At3g05680 SYNGENTA 114438
Genomic Sequence (from TAIR)
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ACTCCTCTTCAGGCTCTATTAAGTGACCGTGACAAGCTGTGTCAGCTACTGGAACAACATCCAAAGTTAATGCAGATGCTTCAGGTTCGATTTGTTTACT
TGTTTTTATGTGCTTTTTGAAAGCATCATCAACCTTTGTGTGTTAATTGTAGAGTTACTGAAATAGGTTTTGTTCTTGTTGGTTGTGACAGGAAAAACTT
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| Start of BLAST Alignment: | NT 9707 / Exon 22 of 24 |
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BLAST Details: Query Sequence: 114438_LB Length: (893 letters) Database: Genes from AGI, Total Genome (DNA); Smallest Sum High Probability Sequences producing High-scoring Segment Pairs: Score P(N) N At3g05680 68416.t00573 expressed protein 3429 2.4e-149 1 >At3g05680 68416.t00573 expressed protein Length = 10,495 Plus Strand HSPs: Score = 3429 (520.5 bits), Expect = 2.4e-149, P = 2.4e-149 Identities = 705/724 (97%), Positives = 705/724 (97%), Strand = Plus / Plus Query: 170 TAAGCGTCAATTTGTTTACACTTACAAAACCCATTTCAGATTCCAATGCATCAGATGCAG 229 | || | ||| || | || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 9708 TCAGAG-CAAGGAGTAT-CAATG-CAAAACCCATTTCAGATTCCAATGCATCAGATGCAG 9764 Query: 230 CTGATGCAACAGACGCAAGTCCAGCCTTACTATCACCCTCCTCAACANCAAGAANATNTC 289 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || Sbjct: 9765 CTGATGCAACAGACGCAAGTCCAGCCTTACTATCACCCTCCTCAACAACAAGA-GATCTC 9823 Query: 290 CCAGGTGCAGCAACAGCAACAGCATCATGCNTGTTCAAGGTCAGCAAGGAGCTGGGACTT 349 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 9824 CCAGGTGCAGCAACAGCAACAGCATCATGC-TGTTCAAGGTCAGCAAGGAGCTGGGACTT 9882 Query: 350 CCCAGCAACAAGAATCTGGAATGTCATTACATGATTACTTCAAGTCCCCTGAAGCCATTC 409 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 9883 CCCAGCAACAAGAATCTGGAATGTCATTACATGATTACTTCAAGTCCCCTGAAGCCATTC 9942 Query: 410 AGGTTTGTAATCCACATCCTTGGTAATGAATGATACGCTGATTTGTTTTGTTTAGTAGTA 469 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 9943 AGGTTTGTAATCCACATCCTTGGTAATGAATGATACGCTGATTTGTTTTGTTTAGTAGTA 10002 Query: 470 TTACGTGCCACAGCTGACCATAATTCTTAAAACTCCTCTTCAGGCTCTATTAAGTGACCG 529 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10003 TTACGTGCCACAGCTGACCATAATTCTTAAAACTCCTCTTCAGGCTCTATTAAGTGACCG 10062 Query: 530 TGACAAGCTGTGTCAGCTACTGGAACAACATCCAAAGTTAATGCAGATGCTTCAGGTTCG 589 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10063 TGACAAGCTGTGTCAGCTACTGGAACAACATCCAAAGTTAATGCAGATGCTTCAGGTTCG 10122 Query: 590 ATTTGTTTACTTGTTTTTATGTGCTTTTTGAAAGCATCATCAACCTTTGTGTGTTAATTG 649 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10123 ATTTGTTTACTTGTTTTTATGTGCTTTTTGAAAGCATCATCAACCTTTGTGTGTTAATTG 10182 Query: 650 TAGAGTTACTGAAATAGGTTTTGTTCTTGTTGGTTGTGACAGGAAAAACTTGGGCAGCTA 709 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10183 TAGAGTTACTGAAATAGGTTTTGTTCTTGTTGGTTGTGACAGGAAAAACTTGGGCAGCTA 10242 Query: 710 TGAGAAGAGAGAGACTTGTCAGCAAATACATCCCTTTGGCTTACTAGTTGCTTTTCAATT 769 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10243 TGAGAAGAGAGAGACTTGTCAGCAAATACATCCCTTTGGCTTACTAGTTGCTTTTCAATT 10302 Query: 770 TCTGTAATGTCTAATAACATGTACATTGTTTCAGTTAATATGTAGACAAAAGCGGTAATC 829 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10303 TCTGTAATGTCTAATAACATGTACATTGTTTCAGTTAATATGTAGACAAAAGCGGTAATC 10362 Query: 830 GGTATCGCTTTCTGNTGNTGGTTAGTCATATTCATGTACATTAGCTAGAAAAGAAACTCA 889 |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10363 GGTATCGCTTTCTGTTGTTGTTTAGTCATATTCATGTACATTAGCTAGAAAAGAAACTCA 10422 Query: 890 ACCT 893 |||| Sbjct: 10423 ACCT 10426